El objetivo de la ingeniería de sistemas aplicada en la medicina es, prestar servicio, ayudar a los profesionales de la salud para mejorar la calidad de atención, la eficiencia en diferentes dispositivos tecnológicos, agilidad en análisis, diagnósticos y reducción de costos . Se aplica a la medicina, laboratorio de análisis clínicos, dispositivos electrónicos para hacer mediciones, archivos de imágenes, software de gestión hospitalaria, de manejo de turnos, de historias clínicas, bases de datos de pacientes, diseño de maquinarias, nanotecnología, microcirugías.
Por tal motivo, la ingeniería de sistemas es multidisciplinaria, capacitada para dar soluciones a los diferentes problemas encontrados en el área de la salud.
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